2005年,艾比湖湿地发现马鹿,基因构成与新疆其它马鹿不同,是新发现的地理亚种。研究人员对这种马鹿进行基因分析后发现，其基因构成与新疆马鹿亚种天山马鹿、阿尔泰马鹿较远，而与塔里木马鹿的基因区别最大，却与甘肃马鹿的基因相近。它是新疆另一个马鹿新亚种，数量仅有110头以上。新疆科研人员根据生存区域，将其定名为艾比湖马鹿。

在艾比湖生物资源中,首屈一指的是卤虫,卤虫被人们称作“软黄金”。在中国100多个盐湖中,艾比湖的卤虫产量名列前茅。

艾比湖湿地自然保护区因其独特的荒漠生物多样性,已成为国内极端干旱区荒漠生态系统的典型代表。

07 巴音布鲁克天鹅国家级自然保护区

巴音布鲁克自然保护区位于巴音郭楞蒙古自治州和静县境内天山中部的尤尔都斯盆地,东西长200公里,南北宽10公里,面积14万多公顷。主要保护对象为天鹅等水禽,属湿地类型自然保护区。

保护区四周融雪水所形成的无数大、小河流皆汇入开都河中,九曲十八弯的河道沿岸形成了大约13.7万公顷的沼泽草地和湖泊。

驰名中外的“天鹅湖”就在尤尔都斯盆地的东南部,是由众多相互串联的小湖组成的大面积沼泽地。

天鹅湖面积约3万公顷,是中国最大的天鹅繁殖地和栖息地,其中大天鹅数量最多,有近1万只,同时还有小天鹅和疣鼻天鹅、秃鹜、灰雁等各种鸟类共计128种,数量达数10万只,是名副其实的“鸟类天堂”。

巴音布鲁克天鹅自然保护区建立以来,天鹅数量逐年增加,乱捕滥猎得到了制止,有效地保护了天鹅栖息地,稳住了大天鹅繁殖种群,天鹅数量由1980年保护区建立时的2000余只,恢复到目前的近1万只。

08 甘家湖梭梭林国家级自然保护区

甘家湖梭梭林自然保护区位于塔城地区乌苏市和博尔塔拉蒙古自治州精河县境内，面积5万多公顷，主要保护对象为梭梭林及其生境。

保护区是荒漠代表植物梭梭生长最好和分布最集中的地区，具有温带荒漠生态系统的典型性和丰富的物种资源。

荒漠林是该保护区最重要的资源，树种有白梭梭、梭梭、柳、胡杨、铃铛刺、沙拐枣等。

此外还有较高药用价值的肉苁蓉、甘草、罗布麻、枸杞等药用植物资源和国家一级保护野生动物黑鹳、波斑鸨。

09阿尔金山罗布泊野骆驼国家级自然保护区

阿尔金山罗布泊自然保护区位于巴音郭楞蒙古自治州若羌县、哈密地区哈密市和吐鲁番地区鄯善县境内，面积780万公顷，是我国第三大自然保护区。

主要保护对象为珍稀濒危物种野骆驼及其栖息地，是中国建立最早的以保护野骆驼及其生境为主的野生动物类型自然保护区。

野骆驼别名野生双峰驼，属于骆驼科，大型偶蹄类，躯体高大，和家养双峰驼十分相似。1883年，俄国探险家普热瓦尔斯基在罗布泊发现了野骆驼，并命名为“野生双峰驼西部亚种”。当时的罗布泊荒漠中常常出没着成群结队的野骆驼，如今国家一级保护野生动物野骆驼仅有800多峰。

10阿尔金山国家级自然保护区

阿尔金山自然保护区面积450万公顷，位于巴音郭楞蒙古自治州且末县境内，主要保护对象为藏羚羊、野毛牛等野生动物。阿尔金山自然保护区是高原生态系统类型的典型代表。